Le mode d'évaluation privilégié en pédagogie spécialisée est l'évaluation continue et formative, qui permet un compte rendu régulier aux élèves et aux parents. L'évolution de l'enfant ou de l'adolescent est décrite dans un rapport d'évaluation en fin de période ou en fin d'année scolaire. Les examens de fin d'année et les bulletins de notes sont plutôt rares.

Les élèves intégrés à l'école ordinaire et qui suivent le plan d'étude ordinaire sont évalués comme les autres élèves. Ceux qui sont en situation de handicap peuvent demander des mesures de compensation des désavantages (p. ex.: prolongation du temps accordé pour passer un examen, accompagnement par une tierce personne [par ex., dans le cas d’une personne déficiente auditive, un ou une interprète de la langue des signes durant un examen oral], adaptation des supports ou formes d’examen).